SCPではサンプルが置かれている状態をステータスという分類で管理しており、検索処理や運用管理に利用することができます。

SCPでは、サンプルを収納するフリーズボックス、ラック等を「トレイ」といいます。登録できるトレイタイプの数に制限はありません。トレイタイプごとに容器の収納数・アドレスの表示方法を設定できます。

SCPではサンプルを「容器」という単位で管理します。容器タイプごとに最大容量、デフォルト容量（データ登録時の初期値）を設定できます。